舅舅有案底一般不会影响外甥考公务员。根据公务员政审规定：直系血亲中或对本人有较大影响的旁系血亲中有被判处死刑或者正在服刑的属于政审不合格，不能录取的。录用考核的内容为德、能、勤、绩四个方面。德，主要指政治思想表现、工作作风、职业道德和品德修养；主要指从事本职工作所具备的基本能力和应用能力；勤，主要是事业心、工作态度和勤奋精神；绩，主要是工作实绩，包括完成工作的数量、质量、效率和所产生的效益。
相关依据：
《公务员政审规定》第四条　考核和政审的内容包括：政治思想表现、道德品质、工作能力、工作实绩、缺点和不足、回避的关系以及直系血亲和对本人有重大影响旁系血亲的情况等。