第一，犯罪客体不同。贪污罪是复杂客体，即侵犯了国家工作人员的职务廉洁性，也侵犯公共财产所有权，而职务侵占罪的客体是简单客体，只侵犯单位所有财产所有权；其二，犯罪主体不同。贪污罪的主体是国家工作人员和受国家机关，国有公司，企业，事业单位，人民团体委托管理经营国有财产的工作人员；而职务侵占罪的主体则是公司企业中不具有国家工作人员身份的工作人员。