由公安机关及检察院承担犯罪嫌疑人有罪的证明责任。非法持有毒品或非法持有枪支的涉嫌违法犯罪，由公安机关进行侦查，收集、调取犯罪嫌疑人有罪或者无罪、罪轻或者罪重的证据材料，然后由检察院提起公诉。
《刑事诉讼法》第一百一十五条，公安机关对已经立案的刑事案件，应当进行侦查，收集、调取犯罪嫌疑人有罪或者无罪、罪轻或者罪重的证据材料。对现行犯或者重大嫌疑分子可以依法先行拘留，对符合逮捕条件的犯罪嫌疑人，应当依法逮捕。