根据全国爱卫办的部署和地方各级爱卫办的实际需要，中国疾病预防控制中心负责农村改厕的不定期技术指导。省、地市级疾病预防控制机构承担所辖地区农村改厕的技术指导、技术培训、粪便无害化效果监测与卫生学评价。检测、分析、评价方法按照《粪便无害化卫生标准》执行。县级疾病预防控制机构负责所辖地区农村改厕技术工作，包括对施工单位与个人、检查验收人员、基层干部等相关人员进行技术培训，指派专业技术人员承担相关的健康教育工作等。技术培训内容包括：粪便无害化原理、厕所建造技术、厕所使用与管理要求、厕所建造质量的现场检查与验收方法、厕所的卫生学评价方法、改厕与肠道传染病等防控相关卫生知识以及传播技巧等。