交通事故保险公司勘察现场跟事故科出的认定书不一致，可由事故科和保险公司协商解决，如果协商不成，可上诉法院，基本上是以事故科出的认定书为依据的，所以保险公司会理赔。
法律依据：《中华人民共和国侵权责任法》第五十三条　
机动车驾驶人发生交通事故后逃逸，该机动车参加强制保险的，由保险公司在机动车强制保险责任限额范围内予以赔偿；机动车不明或者该机动车未参加强制保险，需要支付被侵权人人身伤亡的抢救、丧葬等费用的，由道路交通事故社会救助基金垫付。道路交通事故社会救助基金垫付后，其管理机构有权向交通事故责任人追偿。