两个章的用途是不一样的 以下详情：
1）公章是指机关、团体、企事业单位使用的印章。 由于公安部对办理刻制印章的手续未作统一规定，所以各地公安机关对刻制印章手续的规定有所不同。根据刻制印章的种类不同，手续也不一样。
任何单位公章的使用，必须严格遵守领导批准制度。即每次使用单位公章都必须由单位法定代表人[3-4] 批准同意，若单位法定代表人外出或因其他重要任务不能批准使用，也必须由单位法定代表人授权副职等合适人员批准使用。具体经管人员不得擅自使用单位公章办理任何事情。单位公章若因管理不善，造成损坏、遗失或被盗，除按有关法律、制度追究责任人责任外，须尽快向上级及相关部门报告，一面采取相应措施挽救损失；一面尽快补办手续，尽快补刻启用新印章，以免贻误正常工作。
2） 财务专用章又称财务印鉴章，适合财务章须硬质的材料如：牛角印章、黄铜印等。字体为宋体和隶书，印章尺寸大小由各市、县地方税局确定。
财务专用章，在用途上，规定如下：
为办理单位会计核算和银行结算业务，会计中心为各单位统一刻制了冠有单位名称和“会计中心(序号)”字样的财务专用章，并经单位领导授权后使用。单位原有的财务专用章限用于内部财务管理，但不得用于银行结算。省财政厅为此还专门行文予以规范。
会计中心对财务专用章的使用范围严格限制，并采取与会计主管印章双人分管、保险柜另行存放等项措施，以确保印鉴安全。
单位开户时的账户名称为单位法定名称，预留银行印鉴为单位财务专用章、负责本单位会计核算的核算部会计主管印章和单位确定的财务负责人印章。其中财务专用章由会计中心核算部保存，单位的财务负责人印章由单位报账员负责保存，于每次报账时对支票审核无误后才盖章。银行账户开设后，经单位审核同意并在开户申请上加盖单位行政公章方可使用。单位银行账户的使用，需中心与单位分别执存的三个印鉴加盖齐全方为有效，否则银行不予受理。