被告人有一套小产权房，法院不能强制执行。因为小产权房屋是非法的，法院如果查封、拍卖，就会使非法的变成合法的，会使所有的小产权房屋都会通过法院的诉讼程序来合法化。 但是，当事人之间可以自行协商，被执行人可以将小产权房屋自行抵债，只要不经过法院认可就行。