拆迁补偿协议有约定按照约定处理，没有约定建议协商解决。对于行政机关作出的具体的行政行为不服的，可以向其上级机关提起行政复议，也可以直接向法院提起行政诉讼。建议再合理期限内进行复议或者提起诉讼。也可以委托律师代为进行复议申请或者起诉。