土地确权是指确认土地的所有权归属的问题。如果您拥有合法的土地使用权证，并且在土地上修建了建筑物或设施，则有权要求对方停止侵权行为并赔偿损失。 对于土地被占用了5平方米的情况，您可以先与对方进行协商解决，看是否可以达成和解。如果无法达成一致，那么您可以通过法律途径维护自己的权益。具体来说，您可以向法院提起诉讼，请求确认您的土地所有权，并要求对方停止侵害、恢复原状以及赔偿相应的经济损失等。 如果您已经收到了政府出具的调解协议，建议您按照协议约定处理相关事宜。同时，也可以考虑聘请专业的律师协助处理此事，以确保自己的合法权益得到保障。