土地使用证办理程序有：1、申请登记；2、地籍调查；3、权属审核；4、注册登记。填写《土地登记卡》、《土地归户卡》和《土地使用证》；5、颁发土地证书。申请人凭身份证和《土地使用登记收件单》，领取《土地使用证》。