面对员工申请劳动仲裁的情况，公司应采取以下措施来减少损失： 1. **立即支付拖欠工资**：根据《中华人民共和国劳动法》规定，用人单位应当按时足额支付劳动者工资。拖欠工资是违法行为，应立即支付以避免进一步的法律风险。 2. **与员工沟通协商**：积极与员工沟通，了解他们的诉求，尝试通过协商的方式解决争议，减少仲裁或诉讼的可能性。 3. **处理未签订劳动合同问题**：对于未签订劳动合同的员工，根据《劳动合同法》规定，自用工之日起一个月内未签订书面劳动合同的，应当支付双倍工资。公司应立即与这些员工补签劳动合同，以减少双倍工资的支付。 4. **审查辞职流程**：对于已提交辞职报告的员工，公司应审查辞职流程是否合规，并尽快办理相关手续，避免因拖延办理而产生额外的法律责任。 5. **收集证据**：准备与劳动争议相关的所有证据材料，包括工资支付记录、员工工作记录、社保缴纳记录等，为可能的仲裁或诉讼做好准备。 6. **咨询专业律师**：在处理此类问题时，建议咨询专业律师，获取专业的法律意见和指导，以确保公司在法律框架内采取最合适的行动。 7. **制定预防措施**：为避免未来发生类似情况，公司应加强内部管理，确保按时支付工资，规范劳动合同的签订和执行，以及完善员工辞职流程。 通过上述措施，公司可以在一定程度上减少因劳动争议带来的损失，并维护公司的合法权益。