旷工三天若员工无违法违规行为，员工与公司协商一致办理离职手续的，公司应该全额支付工资。若员工旷工三天未办理离职手续直接离职的，但无其他违法、损害公司权益行为的，一般根据员工的在职时间进行核算工作。若是给公司造成损失的，公司可基于法律规定要求劳动者赔偿损失。