首先与其进行协商，让公司知道并且明确其恶意扣押离职人员证书是违法行为，劳动法明确规定企业不得以任何理由收取职工的押金和证件，可以去劳动仲裁部门进行投诉，这也是通过法律手段要回证件的辅证。