如果没有基础法律关系，或者基于不合法的情况下，打的欠条，法院仍然会作为民事案件受理（因为立案庭不审查实体），但是在审判过程中，如果你的主张是合法合理有效，且有相关依据的，或者公安已经立案了，那民事案件会暂停或者原告的主张会被驳回。