1，公司组织员工培训，并和员工签培训协议是合法有效的。其实协议就相当于劳动合同的性质。 2，根据新劳动法规定，公司可以组织员工进行培训，但是不能收取培训费。 3，公司是可以与被组织的培训的员工签订有违约金的合同，但违约金太高，此不合法。