人民调解协议经过法院司法确认后不能起诉了，也不能申请再审。因为司法确认的人民调解协议已经具有法律效力。 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第三百八十条 适用特别程序、督促程序、公示催告程序、破产程序等非讼程序审理的案件，当事人不得申请再审。