根据国家相关法律的规定，自建房屋如果没有房产证，房屋也是不会受到法律保护的，不过农村自建房可以通过以下两种方式来办理产权证：1、申请宅基地使用权。2、经过规划建设办批准设立的合格房屋，可以向当地的房管所提出申请，并且提交土地使用证等相关资料，在审批合格后予以颁发房产证。 需要注意的是，由于农村宅基地的使用权其实是集体组织对于本村村民的一种福利分配，因此转让方面是受到一定的限制，如果村民想要进行土地以及房屋产权的转让，应当先提交到农村集体组织之中等待集体组织批准同意转让之后，才可以进行转让。另外，如果受让方并不是该农村集体组织成员，除了法律法规的规定之外，房屋登记机构也不能办理转移登记。此外，农村集体土地的房屋也不能办理抵押登记。