关于贷款服务费用的问题。 一般来说，银行或金融机构会向借款人收取一定的手续费或管理费。这个费用通常会在借款合同中明确约定，并在还款时从本金和利息中扣除。 如果协议中有提到3%的服务费，那么需要确认是否是按照借款金额的一定比例来计算的。如果确实是这样，那么这部分费用应该被直接计入到借款的本金中，而不是作为服务费单独扣除。 实际上，如果扣除的是6%，这可能意味着服务费占了借款总额的比例较大，或者可能是额外附加的费用。无论哪种情况，都应该进行仔细核对，确保所有费用都是合法合理并明示的。 在处理这类争议时，建议咨询专业的法律顾问以获得更准确的解答和指导。同时，也可以参考相关的法律法规，以便更好地保护自己的权益。 以上信息仅供参考，请根据实际情况具体分析和处理。