根据《中华人民共和国建筑法》规定。“建筑施工企业应当按照国家有关规定提取安全费用，专户存储，专项用于安全生产，并接受建设行政主管部门和财政部门的监督。”因此，将工程款作为保证金退付给施工队是不合法的行为。这种行为可能违反了法律规定，导致施工单位的资金无法正常流转，影响其正常的生产经营活动。建议您在处理此类事项时，遵循相关法律法规，确保资金的安全流转，避免产生不必要的纠纷。