关于青苗费的赔偿问题，需要根据具体情况来确定。如果王进元是在未经王常元同意的情况下种植的农作物，那么可能不会得到任何赔偿。 然而，如果王进元已经通过合法途径获得了王常元土地的所有权或使用权，并且有证据表明他在使用该土地时得到了王常元的许可，则他有权要求得到相应的青苗费补偿。在这种情况下，王进元可以向当地政府部门提出申请，由政府进行评估和决定是否给予补偿。 另外，如果王进元能够提供充分的证据证明自己在使用土地时得到了王常元的允许，并且能够证明其种植行为与王常元的大沟底土地无关，那么他也有可能获得青苗费的补偿。 总之，具体的处理方式需要依据实际情况和相关法律规定来确定，建议你咨询专业的法律人士以获取更准确的解答。