您好！根据法律规定，如果夫妻双方已经分居三年，并且想要离婚，但是一方的结婚证在对方手中，那么您可能需要采取一些额外的步骤来解决这个问题。首先，您可以尝试与对方沟通，看看是否能够达成协议，或者找到其他方式来获取结婚证。 其次，如果您无法亲自到民政局办理离婚手续，可以考虑通过邮寄的方式将申请材料寄给民政局，然后由工作人员进行审核和批准。在此过程中，您需要提供有效的联系方式，以便于及时联系和反馈结果。 最后，建议您在处理此类问题时，尽量保持冷静和理智，避免情绪化，以免影响最终的结果。同时，也可以寻求专业的法律帮助，以确保自己的权益得到保护。