1、协议只是完成特定事件的一个辅助手段。 2、《入股协议》，顾名思义是为了成为公司股东，签订双方为投资人与公司或者控股股东，更多的是类似与《增资扩股协议》。 3、《股权转让协议》，是公司股东与内部的其他股东或者公司以外的第三人签订，主要是就股权转让价款、支付方式、违约责任等内容。 4、一般而言，《入股协议》很少在实际中使用，多数情况下都能被其他协议替代，该协议处于很尴尬的地位。 5、而《股权转让协议》目标更为明确，主要就是应用于股权的对外或者对内转让。 6、在配套文件的使用上，都是需要召开股东会进行决议，并配合《股东会决议》以及修改公司章程，然后才能办理工商变更登记。