《中华人民共和国民法典》规定，一方患有重大疾病的，应当在结婚登记前如实告知另一方；不如实告知的，另一方可以向人民法院请求撤销婚姻。因此，如果女方在结婚时已经患有重大疾病，并且未如实告知男方，那么男方有权请求法院撤销婚姻关系。但是，即使男方提出请求，法院也不一定会判决婚姻无效，因为这需要考虑多个因素，如双方是否自愿、是否存在其他法定情形等。同时，根据我国法律规定，只有重婚、有配偶者与他人同居、实施家庭暴力、虐待或遗弃家庭成员等情况才能构成婚姻无效。因此，在处理此类案件时，建议先了解具体的情况，并寻求专业的法律意见。