您好！根据您提供的情况，合作社的股权变更属于公司内部事务，一般不需要经过法定程序，只要双方达成一致即可。关于您提到的预付款和尾款问题，建议您与对方沟通协商解决，如果无法达成一致，可以考虑通过诉讼方式解决。同时，建议您保留好相关的证据材料，以便在必要时使用。