五保户的住院费应当由医保中心进行报销。《国务院关于在全国建立城市居民最低生活保障制度的通知》第四条，在建立和实施城市居民最低生活保障制度的过程中，各地要教育群众体谅国家的困难，鼓励和支持有劳动能力的保障对象自谋职业、自食其力，通过劳动增加收入，逐步改善生活状况。对从事个体经营的保障对象，应给予必要的扶持。