在您与陈先生就合作事宜达成一致后，双方应签订正式的合作合同或协议。这份文件应当明确界定双方的权利义务以及利润分配方式。根据您的描述，您与陈先生之间存在股权分配的约定，并已按照法律规定完成了相应的手续。因此，在这种情况下，您可以依据上述合同或协议来证明您实际投入的资金为40万元。 请注意，作为律师，我建议您在任何商业活动前都仔细审查相关协议条款，确保所有交易符合当地的法律法规，并尽可能保护自己的合法权益。如果您需要进一步的专业意见，请咨询专业的法律顾问。