是的，如果双方在民事诉讼中达成了调解协议，其中包含了一定比例的“定期金”作为支付赔偿金的方式，且该约定不违反法律规定，则可以通过法院执行程序要求对方按照该约定支付。通常情况下，定期金应以每月或每季度为单位，根据双方协商确定的具体金额和时间进行支付。 然而，在某些情况下，如果定期金的数额过大，或者对一方不公平，可能需要重新评估并调整赔偿金的支付方式。在这种情况下，建议与法官沟通，了解是否有其他可行的解决方案。同时，确保所有交易和支付都是基于公正和公平的原则，并遵守相关法律法规的规定。