根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释的规定，如果夫妻双方因感情不和而分居满两年，并且在分居期间共同出资购买了一套经济适用房，那么该房屋属于夫妻共同财产。因此，在离婚时，无论男女双方是否同意出钱共同支付购房款，该房屋都应当视为夫妻共同财产。 然而，具体到你的情况，如果你与对方已经协议离婚，但其中未明确表示对经济适用房的处理方式，则需要按照法律规定进行处理。一般来说，法院会优先考虑维护家庭成员的利益，所以在分割财产时也会考虑到照顾无过错方的原则。 如果你想要进一步了解关于离婚房产分割的具体规定，建议咨询专业的房产律师或法律顾问。他们可以为你提供更详细和准确的法律意见。