根据《中华人民共和国民法典》的规定，债权人与债务人订立分期还款协议时，应当明确约定还款期限。如果债务人按照协议规定的时间和金额履行了还款义务，债权人有权要求债务人一次性偿还剩余款项或者拍卖房产。但是，在实际操作中，债权人必须确保债务人已经完全履行了还款义务，并且没有违反任何其他条款或条件。在进行拍卖前，债权人需要先向法院申请强制执行程序，并提供相关证据证明债权的存在以及债务人的违约情况。因此，在这种情况下，债权人是否可以选择拍卖房产取决于其是否满足上述条件。