您好！如果您想要在工商注册为连锁店铺，但不想使用总店的名称，您可以在申请时选择不同的企业类型或名称，并且需要确保您的经营行为与总店保持一致。具体操作建议咨询当地的工商管理局或者专业的法律顾问，以获取最准确和具体的指导。同时，在进行商业活动时，请务必遵守相关法律法规，合法合规地经营。