您好，根据我国法律规定，如果您的妹夫是在执行职务过程中发生的交通事故，并且导致了死亡的结果，那么可能需要承担一定的赔偿责任。对于工程款的处理，则需要具体情况具体分析，建议您与相关的工程项目方进行协商或诉讼解决。同时，关于赔偿金的具体数额和处理方式，也需要结合实际情况进行考虑。希望我的回答能够帮助到您。