您好！根据我国相关法律规定，如果双方没有办理结婚登记手续，但存在合法的同居关系，则可以视为婚姻关系。在这种情况下的借贷行为，通常被认为具有法律效力。 然而，在您的情况下，您和前妻已经分居并签订了借款协议，并且该协议已被公证。在这种情况下，如果前妻提出诉讼要求还款，法院可能会考虑是否认可该借据作为证据。具体而言，法院将评估该借据的真实性、合法性以及与您之间的法律关系。 如果您认为该借据是真实的，且符合法定程序（如公证），那么法院可能不会否定其有效性。但是，如果该借据存在伪造或欺诈行为，或者借款金额超过了法律规定上限等情形，法院可能会拒绝承认其为有效的债务证明。 因此，建议您尽快寻求专业的法律顾问帮助，以便更好地了解情况并采取适当的行动。