在这种情况下，虽然没有书面合同，但根据《中华人民共和国合同法》的相关规定，口头合同同样具有法律效力。首先，您需要收集和整理所有可能证明工程承包关系和工程完成情况的证据，包括但不限于工程量清单、施工记录、材料购买凭证、工人工资支付记录、与村支书的沟通记录等。 其次，如果对方承认欠款5万元，这可以作为对方承认债务的证据。您可以要求对方出具书面确认或者通过其他方式固定这一承认。 接下来，您可以委托律师与对方进行协商，尝试达成还款协议。如果协商不成，您可以考虑通过法律途径解决，比如向人民法院提起诉讼。在诉讼中，法院会根据您提供的证据来判断是否存在工程承包关系以及工程款的数额。 请注意，诉讼是一个复杂的过程，可能涉及举证责任、诉讼时效等问题。因此，建议您在律师的指导下进行，以确保您的权益得到有效维护。同时，考虑到工程已经完成三年多，需要注意诉讼时效的问题，一般民事诉讼时效为三年，但具体情况需要根据案件细节确定。