根据我国法律规定，如果双方已经分居三年以上，并且未办理离婚手续，那么在这一期间内发生的婚姻关系解除行为（如分居）不影响婚姻关系的存在。因此，在这种情况下的婚姻关系仍然有效，双方都有权要求对方遵守相关的法律责任。 至于车辆贷款和归还的问题，通常情况下，个人债务属于个人财产，除非有证据证明该债务是在婚姻存续期间为家庭共同生活所负的债务。因此，如果贷款用于购车，而购车是为了满足个人需要而非家庭共同生活，则可能不会被视为夫妻共同财产。 然而，具体处理方式还需结合实际情况和相关法律法规进行分析。建议您详细咨询专业人士以获得更准确的解答。