根据法律规定，公司员工将本应支付给施工单位的伙食费用非法扣留并据为己有，构成了侵占罪。如果施工单位能够证明该款项属于其所有，并且该员工的行为已经构成犯罪，那么公司员工可能会面临刑事责任。 此外，公司员工的行为也违反了公司内部规定和职业道德准则，可能导致公司的声誉受损。因此，建议你公司立即采取措施纠正这一行为，并加强内部管理，避免类似情况再次发生。同时，也可以考虑与员工进行沟通和教育，提高他们的职业素养和道德意识。