是的，您可以向法院提起诉讼。根据您的描述，您与那个公司之间的合作关系以及按照合同的要求完成了药材的收购，并且公司拖欠了您的利润。这种情况下，您有权要求公司支付应得的利润并承担相应的法律责任。 在进行诉讼之前，建议您收集相关证据，例如合同、发票、银行交易记录等，以支持您的主张。同时，了解当地关于合伙人权益保护的相关法律规定和司法解释，以便更好地维护自己的合法权益。 最后，如果您需要具体的法律帮助或有其他相关的问题，请随时告诉我，我会尽力提供帮助。