鉴于农村一个家庭有两个宅基地的情况国家会依具体情况进行处理，如因家庭分割造成多房、户口回迁造成多房、继承多房的这几种情况，国家是允许确权登记的。对于违法家庭也会根据不同情况进行有偿使用、转移、甚至强拆的处理。