可以起诉借款人。根据《中华人民共和国民法典》的规定，自然人之间的借贷，如果当事人之间有书面的借款合同或者口头约定，且借款人已经实际收到款项，则该借款合同成立并生效，借款人应当按照合同约定偿还借款本金及利息。在您的情况下，虽然借款协议上的印章是公司的，但是借款实际上是由借款人自己使用的，因此借款协议仍然有效。如果您认为借款人没有按期还款，您可以向法院提起诉讼，要求借款人偿还借款本金以及相应的利息。同时，您也可以申请法院对借款人名下的财产进行保全，以确保债权得到保障。