《刑事诉讼法》第3条明确规定。“审判人员和公诉人、辩护人的权利义务由法律规定。” 因此，司法保护主义与未经人民法院依法判决不得确定有罪原则之间的关系在于。 司法保护主义强调被告人应被给予必要的司法保护，以保障其合法权益。而未经人民法院依法判决不得确定有罪原则则意味着在没有经过法庭审理的情况下，任何人不得被认定为有罪。 这两者都是为了确保程序正义，维护被告人的权益，防止冤假错案的发生。因此，两者并不矛盾，而是相辅相成的。