分析企业注销对劳动关系的影响，我们首先要了解注销可以造成企业主体怎样的变化。 《公司登记管理条例》第38条规定，经公司登记机关核准注销登记，公司终止。企业法人被依法注销后，其法人资格与经营资格即告终止，公司也因此丧失了用工主体资格。劳动关系因一方失去主体资格而无法继续存续。因此，B公司在申请注销时应依法终止与员工的劳动合同，并根据《劳动合同法》第46条的规定支付员工经济补偿金。