根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，当事人可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼。因此，在重庆市内，无论被告是否在周边或者原告位于主城区，都可以选择有管辖权的人民法院进行起诉。 具体而言，如果案件涉及合同纠纷、侵权责任等民事争议，可以选择被告所在地或有管辖权的人民法院进行起诉；如果是离婚、继承等婚姻家庭纠纷，则可以选择原告所在地或有管辖权的人民法院进行起诉。 需要注意的是，具体的管辖规定可能会因地区而异，建议您在起诉前查阅相关法律规定，并联系当地的法院了解最新的管辖规则。