根据我国《中华人民共和国人口与计划生育法》的规定，夫妻双方均为农村户籍，并且女方已经领取了独生子女证的情况下，如果男方的结婚证丢失，可以按照以下步骤申请补领。 首先，需要到女方户口所在地的县级人民政府人口和计划生育行政部门或者乡（镇）人民政府人口和计划生育工作机构提出书面申请。 申请时应当提交本人身份证明以及婚姻状况证明等材料。其中，婚姻状况证明包括离婚证书、离婚判决书、丧偶证明等。 县级人民政府人口和计划生育行政部门或者乡（镇）人民政府人口和计划生育工作机构应当自收到申请之日起十五日内予以办理，并出具补发的独生子女证。 需要注意的是，如果男方在申请过程中提供虚假信息，可能导致其无法获得补发的独生子女证，甚至面临法律责任。因此，在申请补发独生子女证的过程中，应诚实守信，提供真实有效的信息。