首先，根据您提供的信息，学校在您的合同中并未明确说明怀孕的情况是否属于“重大疾病或传染病”的范畴。因此，学校有权依据其自身的规定来决定是否扣除部分学费。 然而，在考虑是否要求返还剩余费用时，建议您与学校的相关部门沟通，了解他们对这种情况的具体处理方式和理由。如果您认为学校的做法不合理，可以尝试通过协商解决争议，争取更多的权益。 此外，如果学校坚持按照合同中的规定进行扣款，您可以考虑向当地的消费者保护机构投诉，以维护自己的合法权益。同时，也可以寻求其他途径如仲裁或诉讼等方式解决问题。最终，重要的是确保您的权益得到保障，并尽可能地减少损失。