根据您提供的信息，如果您的前女友在购买房屋时使用了其住房公积金，并且该公积金账户中余额为35万元，则意味着她在购房时有义务偿还这笔款项。如果您已经支付了16万元作为首付，并且还清了剩余的贷款（即35万元），那么您有权要求退还剩余的29万元。 然而，如果您的前女友没有按照约定归还公积金中的款项，而是将其用于其他用途，或者存在其他的经济纠纷，导致无法履行还款义务，此时您可以考虑向法院提起诉讼，以追回这部分资金。 此外，由于您已经支付了部分首付款和贷款，因此您可能有权请求对方赔偿您因购房而产生的实际损失，包括但不限于利息、违约金等。 请记得，在处理此类争议时，应确保所有证据都充分且合法，以便能够有效地维护自己的权益。