在某些情况下，如果科长被任命为其他职位，这可能被视为不合规。通常来说，在政府机构中，职位的变动应当通过正式程序进行，如内部调整或外部招聘等。 然而，具体是否违法取决于您所在的具体情况和相关法律法规的规定。如果您对这个职位变动有疑问，请咨询一位法律顾问以获得更准确的法律意见。