一般是按照有利于子女成长的原则，一方有重大疾病，孩子归对方抚养的可能性比较大。

关于离婚时子女的抚养问题，原则上两周岁以下的子女随母亲生活，两周岁以上十周岁以下的子女要考虑跟随哪一方更有利于孩子的成长，十周岁以上的子女要考虑子女自己的意愿。但是如果在离婚时，子女未满两周岁，女方有重大疾病并且子女确实不适合跟其一起生活的话，那么法院会酌情考虑将子女的抚养权判给男方。

法律依据：

最高人民法院《关于人民法院审理离婚案件处理子女抚养问题的若干具体意见》

1、两周岁以下的子女，一般随母方生活。母方有下列情形之一的，可随父方生活：

（1）患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的；

（2）有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的；

（3）因其他原因，子女确无法随母方生活的。

3、对两周岁以上未成年的子女，父方和母方均要求随其生活，一方有下列情形之一的，可予优先考虑：

（1）已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力的；

（2）子女随其生活时间较长，改变生活环境对子女健康成长明显不利的；

（3）无其他子女，而另一方有其他子女的；

（4）子女随其生活，对子女成长有利，而另一方患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，或者有其他不利于子女身心健康的情形，不宜与子女共同生活的。

16、一方要求变更子女抚养关系有下列情形之一的，应予支持。

（1）与子女共同生活的一方因患严重疾病或因伤残无力继续抚养子女的；

（2）与子女共同生活的一方不尽抚养义务或有虐待子女行为，或其与子女共同生活对子女身心健康确有不利影响的；

（3）十周岁以上未成年子女，愿随另一方生活，该方又有抚养能力的；

（4）有其他正当理由需要变更的。