您好，根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，您和您的配偶在未办理正式的结婚登记手续的情况下同居生活，并使用结婚证申请了低保，这可能构成事实上的重婚行为。因此，在提起离婚诉讼时，法院可能会认定你们之间的关系不符合法律规定，从而驳回您的诉讼请求。 此外，由于双方分居两地，且男方不愿离婚，这意味着你们之间存在较大的矛盾或分歧，需要通过进一步的沟通和协商来解决这些问题。建议您尝试与对方进行深入的交流，寻找共同点并寻求解决问题的方法。 同时，考虑到财产分割和子女抚养权等问题，您可以考虑聘请专业的家庭律师提供法律帮助，以确保自己的权益得到充分保护。 最后，希望您能够珍惜彼此的感情，同时也尊重对方的选择，找到一个适合双方的生活方式。祝您早日解决纷争，恢复和谐的家庭氛围。