根据《中华人民共和国刑法》第三百八十二条规定，挪用公款归个人使用，进行非法活动的，或者挪用公款数额较大、进行营利活动的，或者挪用公款数额较大、超过三个月未还的，是挪用公款罪。因此，如果合伙人挪用了公司的资金用于非法活动或营利活动，并且金额达到规定标准，构成犯罪的话，需要承担相应的刑事责任。 在签订和解协议时，可以明确双方同意按照合同约定的方式进行还款，但需要注意的是，在实际操作中，还需要考虑具体的法律规定以及可能产生的法律责任。建议您与法律顾问详细讨论相关事宜，以确保自己的权益得到保护。