你好！运输人工种植的红豆杉树苗并不违法。根据《中华人民共和国种子法》的规定，任何单位和个人不得销售未依法取得种子生产经营许可证或者备案证明的种子，也不得购买和使用无合法有效种子生产经营许可证或者备案证明的种子。因此，在中国境内从事红豆杉树苗的生产、销售活动需要符合相关的法律法规要求，并且必须持有相应的许可证或备案证明。 在实践中，对于人工种植的红豆杉树苗是否属于合法经营的问题，主要取决于其生长环境和用途。如果红豆杉树苗是在特定的环境下（如自然保护区）种植的，并且用于科学研究、教育或其他非商业目的，那么这些树苗可能被视为合法的植物资源，可以进行合理的管理和利用。 然而，如果红豆杉树苗被用于商业交易或作为商品出售，则需要遵守相关法律法规的要求。例如，按照中国的规定，未经许可擅自出口野生动植物及其产品可能会违反国家的保护法规。因此，在处理此类问题时，建议咨询专业的法律人士以获得最准确的法律意见。