学校的做法肯定不合法，根据《工资支付暂行规定》第十六条因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。 经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。 但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的２０％。 若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。 授课老师的本职工作是教课，而没完成招生指标就扣工资与我国法律规定不符，学校做法不合法。